柴油发电机在运转中发生机械故障，轻则造成基本件损坏，重则导致重大机械故障的产生。通常情况下，柴油发电机发生损坏前，其转速、声音、排烟、水温、机油压力等方面会表现出某种不正常迹象，即损坏预兆特性。集装箱发电机于是操作人员应根据预兆的特征迅速做出正确判定，果断采取方法，预防故障发生。
处置方法：一是关油门停止供油，并踏下制动器;二是堵塞进气管，切断空气的进入;三是迅速松开高压油管停止供油;四是车用柴油发电机行走中可用高挡重负载(制动)，使发电机因扭气不足而熄火。
粘缸通常在柴油发电机严重缺水的情形下产生，粘缸前发电机运行无力，水温表指示超过100℃，往机体上滴几滴冷水，有“嘶嘶”的响声，并排白烟，水滴很快蒸发。
处置措施：怠速运转一段时间或熄火摇转曲轴帮助冷却，使水温降至40℃左右，再缓慢加入冷却水。注意不要立即加冷却液，否则会引起机件因局部温度突然下降过快而变形或发生裂痕。
捣缸属破坏性较大的机械损坏，除气门落缸导致捣缸外，大多是由于连杆螺栓松退引起的，连杆螺栓松退或拉伸后，连杆轴承配合间隙增大，这时在主轴箱部位可听到“嗒嗒”的敲击声，敲击声由小变大，*后连杆螺栓完全脱落或折断，连杆及轴承盖甩出，打破机体及有关零件。
柴油发电机作业中转速突然减小，负荷加重，发电机冒黑烟，机油压力下降，主轴箱内产生“唧唧”的干摩擦声。
当柴油发电机曲轴轴颈轴肩处因疲劳产生隐性裂纹时，损坏征兆尚不明显，随着裂纹的扩大加重，发电机曲轴箱内发生沉闷的敲击声，速度变化时敲击声加重，发电机冒黑烟，不久，敲击声逐渐增大，发电机产生抖动，主轴断裂，随即熄火。
排烟管严重冒黑烟而突然熄火，主轴无法转动。此时无法再启动柴油发电机进行作业，而应查明起因并加以处理。
(1)早期发现拉缸时应首先加大汽缸滑油注油量。如太热现象没有改变，可采取单缸停油、减少速度、加快活塞冷却等手段，直到太热消除为止。
(5)吊缸检修时，应将活塞与缸套表面上的拉缸痕迹用油石仔细磨平。故障的活塞环必须换新。若活塞和缸套故障严重，应予以换新。
(6)活塞装复时，必须仔细检测气缸上的各注油孔注油是否正常。若活塞和汽缸套均换新，则在装复后应进行磨合，磨合时应从低负载开始逐渐地加负荷并持续运行。